个人简介
办公电话:02151323179
通讯地址:
研究方向: 生物大数据和中药药物筛选
招生专业
院系名称 | 专业大类 | 一级学科 | 专业代码/专业名称 | 学位类型 | 招生类型 | 类型 |
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交叉科学研究院 | 专业学位 | 中药学 | 105600 中药学(专业型) | 专业型 | 硕士 | 全日制 |
教育经历
2006.9–2011.9: 博士生,中国科学院上海生命研究院计算生物学研究所
2002.9- 2006.6: 本科学士学历,山东大学生物科学专业
任职经历
2018.3-现在 副研究员,上海中医药大学交叉科学研究院
2017.10-2018.3: 研究员, 强生中国研发中心
2014.3-2017.9: 研究员, 葛兰素史克上海医药研发中心
2012.6 –2014.3: 博后. 德国柏林马克斯普朗克学会;
2011.9–2012.11: 博后 德国柏林马克斯普朗克学会分子遗传所
研究方向
通过计算机模型和大规模生物数据分析,研究疾病发生的机制和寻找药物干预方案;开发新型计算机分析工具
1. 癌症免疫微环境研究和药物靶点的发现:我们利用目前成熟的pan-cancer数据和动物实验数据,通过大规模筛选和数据建模的方式来研究癌症发生过程中突变和肿瘤微环境的关系,建立肿瘤免疫应答和转移的预测模型。在我们的研究工作中,我们已经搭建了分析平台DEComplexDisease,能够实癌症病人全体的分型。后续希望通过特征基因和肿瘤微环境的关联分析,从而为中药筛选提供靶点基础。
2. 中西药小分子快速筛选的高通量分析平台:建立一个基于表达、蛋白,表观遗传学或者其他数据的预测模型,寻找蛋白质上下游的作用特征,以及在不同作用强度下的生物学反应,通过数学建模的方式,寻找到反应蛋白活性改变的生物学特征变化,从而利用分子特征比对的方式预测中药小分子作用通路,以及他们在生物调控的作用。这些信息可以帮助我们回答多个方面的问题,比如中药小分子潜在的作用靶点有哪些,小分子如何在生物调控网络中起作用;中药制剂中多个小分子是如何协同作用从而达到治病的目的。
3. 老年疾病研究:研究老化和阿尔兹海默的关联: 通过参与国际AMP合作项目,利用数据建模的方式,搭建老化过程和AD发生的关联
目前第一负责人承担的科研课题与经费
序号 | 课题名称 | 研究起止时间 | 经费数(万元) | 备注 |